WonderED K-12 Academy utiliza el aprendizaje basado en proyectos como metodología principal. Los proyectos están vinculados a una serie de competencias desarrolladas para la educación basada en competencias (CBE) del siglo XXI. Este enfoque PBL-CBE crea un entorno de aprendizaje atractivo y divertido que brinda un aprendizaje más profundo y flexibilidad para desarrollar los talentos y las habilidades únicas de cada estudiante. Estas competencias garantizan la preparación para la universidad y la carrera profesional, así como el dominio de las habilidades necesarias para tener éxito en el mundo actual.